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作者: yytsnake 发布日期: 2007-05-07
计算机是死的，人是活的。既然能叠加两个分子，将叠加后的分子用一个键连接起来就变成了一个分子，然后再与另一个分子进行叠加，操作完毕后，将多余的键删掉就可以了。
作者: pharmacydoctor 发布日期: 2007-05-07
谢谢楼上的朋友！但是你的方法是不行，如果可以的话我就不用这么郁闷了
你想如果当你要叠加好几十个分子的时候，你就会感到很乱了
而且我相信hyperchem的设计者应该没有这么笨，只是我现在没有找正确的使用方法而已
作者: yytsnake 发布日期: 2007-05-07
不知你研究的是什么体系，几十个分子，就是用分子力学方法恐怕HYPERCHEM也很难运行出结果。
作者: pharmacydoctor 发布日期: 2007-05-08
别人有文章报道过，但是没有说出具体方法
我要知道分子相似性和空间力场对体系的作用
作者: snoopyzhao 发布日期: 2007-05-08
QUOTE: Originally posted by pharmacydoctor at 2007-5-8 08:16 AM:
别人有文章报道过，但是没有说出具体方法
我要知道分子相似性和空间力场对体系的作用 这个一般不用 hyperchem 叠加吧？选定一个共同结构之后，直接进行旋转与平移就可以了（记得 ccl 上有一个小软件可以做这个），当然，这里只是说刚性的叠加，如果要考虑柔性的话，要用其它专门软件
作者: pharmacydoctor 发布日期: 2007-05-08
谢谢楼上的意见！因为我看的文章是用hyperchem叠加的，其他软件也有，但是没有试用的下载。我只能有hyperchem做了。否则外国人又说我们中国人用盗版。
作者: yytsnake 发布日期: 2007-05-08
如果你有正版的HYPERCHEM，能否让我们了解一下它的全部功能与常见的其它版本有什么不同？
作者: pharmacydoctor 发布日期: 2007-05-09
功能是一样的，但是如果你用盗版来发文章，我想你的麻烦可就是多了
作者: whitewatercn 发布日期: 2007-05-11
想了一个比较笨的办法,希望对楼主有所帮助.
1打开模板分子A,全选,然后复制Ctrl+V
2打开分子B,点粘贴,现在有了A B两个分子,怎样叠合,楼主已经会了,记住点选原子时要先选A(作为第一个原子)
3叠合后保存成sybyl mol2 (ml2)格式,用ultraEdit打开该ml2文件,删除分子A
4 重复2 3两步,直到所有分子都叠合到A的坐标系上
作者: yytsnake 发布日期: 2007-05-11
能否给个图示？看看到底是什么样的叠加？是有规律的还是无序随机的。
作者: shenyudong 发布日期: 2007-05-23
有个简单的叠加方法：chemoffice2006种提供了多分子自动叠加功能，快捷方便
作者: snowingirl 发布日期: 2007-05-27
我用的chemoffice,可以实现多个分子的叠加,楼主不妨试试.惭愧地说一句,hyperchem还没有用过,打算学习学习
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