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【求助】π-π堆积
作者: jinsizeng 发布日期: 2008-03-15
请问
若两个苯并三唑存在π-π堆积，计算π-π堆积的质心距离时所定的质心是按苯环算呢？还是按苯并三唑这个大环算呢？
多谢！
[ Last edited by lingzi326 on 2007-9-20 at 10:51 ]
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相关回复：
作者: tjlicp 发布日期: 2007-09-20
你需要把两个距离都计算出来，然后分别列出来，这样更好！
作者: yalefield 发布日期: 2007-09-20
严重挑衅按苯环算
热烈粉丝按苯并三唑算
作者: alusia 发布日期: 2007-09-20
QUOTE: Originally posted by yalefield at 2007-9-20 11:37 AM:
严重挑衅按苯环算
热烈粉丝按苯并三唑算 ？？？？what meaning？：（
作者: blueskyami 发布日期: 2007-09-20
怎么计算π-π堆积之间的距离啊?
怎么找中心点啊?
用什么软件比较好啊?
作者: zilanyu 发布日期: 2007-09-20
用diamond和ccdc的软件算都很方便，shelx也能算，就是命令麻烦，前两个软件，只需在苯环中画出假原子，在计算两个假原子间的距离就行了
作者: blueskyami 发布日期: 2007-09-20
是啊,怎么画假原子啊?
呵呵
作者: rainwaving 发布日期: 2007-09-21
选中平面原子，然后点stucture/insert atom插入假原子。
作者: zilanyu 发布日期: 2007-09-21
楼上说的对，没个苯环都这样画出假原子后，在diamond里有个象锯齿的图点一下，在分别点住两个假原子，就算出距离了
作者: cccyer 发布日期: 2007-12-06
直线距离最好给出来
diamond中，取出平面
算平面见距离
这个比质心更有意义
作者: 西风少年 发布日期: 2007-12-07
用diamond的误差太大了,还是使用shelxl比较好,首先求出其中一个面的中心(cent/C1 C2 C3 C4...Cn),再用mpln指令就可以求出点到面的距离,即是面到面的距离.
作者: stevenabing 发布日期: 2007-12-07
作者: 元小雪 发布日期: 2007-12-11
楼上说的有道理,平面间距更有说服力一些,精确些,虽然有时候它们是相等的
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