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[求助] 蛋白质活性位点分析
作者: kyon 发布日期: 2008-04-15
请教各位:蛋白质活性位点分析都有什么方法?
达人帮忙介绍一下 多谢
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相关回复:
作者: luai071 发布日期: 2008-04-07
作者: kyon 发布日期: 2008-04-08
多谢楼上提供的网站和文献。
还想继续求助蛋白质活性位点方面的算法和软件
作者: mzymyc 发布日期: 2008-04-08
GRID和MCSS是比较常用的
作者: zdh398 发布日期: 2008-04-08
PASS、Binding Site Analysis和SiteID也可用
作者: montclimber 发布日期: 2008-04-14
提供一个线索:进化踪迹分析法, 通过对蛋白质家族在进化过程中的保守氨基酸进行研究,确定这些氨基酸残基在三维结构中的位置,并预测蛋白质活性位点.
ref. Lichtarge O, J. Mol. Biol, 1996, 257:342-358.
作者: montclimber 发布日期: 2008-04-14
luai071, 请问你提供的这个网站如何在位点预测后看结果? 为何最后没有图片显示啊?
[ Last edited by montclimber on 2008-4-14 at 14:16 ]
作者: luai071 发布日期: 2008-04-14
QUOTE: Originally posted by montclimber at 2008-4-14 14:14:
luai071, 请问你提供的这个网站如何在位点预测后看结果? 为何最后没有图片显示啊?
[ Last edited by montclimber on 2008-4-14 at 14:16 ] 这个恐怕不可能吧,我是做过的,可以保存下来一个PDB文件,预测的活性中心用绿色的网格表示。
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