我想计算几个小檗碱类化合物的二面角,听说Gaussian可以算, 请大虾帮忙, 我们这边虽然有这个软件，但是折腾了很久还是用不起来. 要毕业,急死人了.
由于昨天的帖的分数已经送出去,但是问题没解决,所以继续求助

我的QQ:125513724　　

[ Last edited by lei0736 on 2008-4-9 at 14:46 ]

你先找个建模软件，把分子构型建好
如果你已知结构，那么根本不用高斯，直接用建模软件就可以读出来了，
如果你需要优化结构，那么优化以后再来读取

用 MS
就很简单了 ！

推荐使用“分子锦囊（Sachet）”，一个免费的国产分子建模软件。
可以在这里找到http://www.dirac.cn/products/downloads/

chem office听过没，很简单好用的入门级软件，可以直接测量各参数（键长，键角，二面角）。还具备高斯接口，直接转换为其输入文件，我想这个最合适解决这些小问题了

chemoffice算出来的不是我要的啊:(:(

是两个苯环间的二面角,哪位可以留个联系方式, 我详细咨询一下.

两个苯环间的二面角用GaussView就可以直角读出来的。

优化之后从gaussview读取

如果只需要结构不需要能量，用很小的basis set就可以了

根据计算得到的结构,利用苯环上碳原子的坐标,可用数学方法计算得到两个苯环间的二面角,也可利用3D软件显示出两个苯环间的二面角,用量角尺之类的工具测量得到.

我想选择chemoffice的G入口做input文件夹(怎么做,需要设哪些参数),然后在Gview来看二面角(怎么看). 有详细点的步骤最好了.
对专业的大虾来说，很简单,可是对我这只菜鸟却不容易啊.
谢谢那么多朋友出主意