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当前位置:小木虫 >> 计算模拟 >> 【求助】如何构建PdWO4晶体结构

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【求助】如何构建PdWO4晶体结构


作者: sunmuer    发布日期: 2008-04-15

现在已经有了PdWO4的晶格参数,如何构建呢?
我建模的时候只能画出一个O,其他的O怎么弄上去呢?
相关回复:

作者: jghe   发布日期: 2008-04-10
查CCSD不就完了

作者: hopingzmn   发布日期: 2008-04-10
1. File 》Import 》点击Structures文件夹,选择一个结构类似,也就是属于同一点群的结构,导入直接修改晶格参数即可;
2. 如果没有,但是你知道PbWO4属于哪一点群,在3D图形文件界面下,点击Build 》Build crystal,在弹出的Build Crystal对话框中的Space Group标签,Enter group中输入点群名字;在Lattice Parameters标签中修改晶格参数即可。

作者: aylayl08   发布日期: 2008-04-10
建立类似的空间群后,修改晶格参数后,将原子替换掉,先选择要替换的原子,再点击菜单栏中的modify——modify elements——选择Pd或W或O。构建即完成。之后就可以几何优化,计算别的性能啥的了。

作者: sunmuer   发布日期: 2008-04-10
QUOTE:
Originally posted by hopingzmn at 2008-4-10 15:16:
1. File 》Import 》点击Structures文件夹,选择一个结构类似,也就是属于同一点群的结构,导入直接修改晶格参数即可;
2. 如果没有,但是你知道PbWO4属于哪一点群,在3D图形文件界面下,点击Build 》Build crys ...
我的原子都没有加入呢,怎么替换?

作者: sunmuer   发布日期: 2008-04-10
QUOTE:
Originally posted by aylayl08 at 2008-4-10 17:03:
建立类似的空间群后,修改晶格参数后,将原子替换掉,先选择要替换的原子,再点击菜单栏中的modify——modify elements——选择Pd或W或O。构建即完成。之后就可以几何优化,计算别的性能啥的了。
修改晶格参数后,不是还没有填充原子么?怎么替换呢?
我在build/build crystal/中,选择了晶格参数中给定的点群,然后输入了a,b,c
这时候只是出来个大盒子而已,里面没有任何的元素。

我把晶格参数发上来,帮忙看看怎么做,谢谢!

空间群I41/a
晶格常数a5.456 b5.456
C 12.0222
beta  90°
z   8      代表什么?      
密度(g/cm3)  8.12

作者: sunmuer   发布日期: 2008-04-10
QUOTE:
Originally posted by aylayl08 at 2008-4-10 17:03:
建立类似的空间群后,修改晶格参数后,将原子替换掉,先选择要替换的原子,再点击菜单栏中的modify——modify elements——选择Pd或W或O。构建即完成。之后就可以几何优化,计算别的性能啥的了。
修改晶格参数后,不是还没有填充原子么?怎么替换呢?
我在build/build crystal/中,选择了晶格参数中给定的点群,然后输入了a,b,c
这时候只是出来个大盒子而已,里面没有任何的元素。

我把晶格参数发上来,帮忙看看怎么做,谢谢!

空间群I41/a
晶格常数a=b=5.4679  
C= 12.0222
beta  90°
z   8      代表什么?      
密度(g/cm3)  8.12



Atom (site) Oxid.        x, y, z,                    B,     Occupancy
W1        (4a)        6         0.        0.250        0.125        0        1
Pb1        (4b)        2         0.        0.250        0.625        0        1
O1        (16f)        -2        0.23170(65)        0.11220(58)        0.04300(36)        0        1

作者: aylayl08   发布日期: 2008-04-11
哦,忘说了,你点build,再点击add atoms,就可以添加原子了。我在版面上发了个关于CASTEP的教程,你可以看看建立晶体模型的过程,非常详细,对你会很有帮助的。
http://emuch.net/bbs/viewthread.php?tid=760979&fpage=3

[ Last edited by aylayl08 on 2008-4-11 at 09:35 ]

作者: hopingzmn   发布日期: 2008-04-11
QUOTE:
Originally posted by sunmuer at 2008-4-11 07:32:


修改晶格参数后,不是还没有填充原子么?怎么替换呢?
我在build/build crystal/中,选择了晶格参数中给定的点群,然后输入了a,b,c
这时候只是出来个大盒子而已,里面没有任何的元素。

我把晶格参数发 ...
出来的是个空盒子才是正常的,然后点击Build 》Add atoms,弹出的对话框中点Atoms标签,修改Element,点击右边的“...”会出来一个元素周期表,选择需要的原子;然后在a:b:c:后面的小框中输入你有的坐标,这个都是分数坐标,你要确认Atoms标签右边的Options标签中的Coordinate System对应的是Fractional。其他不用管了,采用默认,点击Add,添加了一种原子。接着同样的方法添加其他类原子。
试试看:)

另外,你说的那个z 8我也不是很清楚代表什么。
再另外,你要建的结构是PdWO4还是PbWO4?

作者: cuihang   发布日期: 2008-04-11
不是光修改参数,他的意思是让你导入一个对称性质相似的晶体,而不只是个框架

作者: sunmuer   发布日期: 2008-04-11
QUOTE:
Originally posted by aylayl08 at 2008-4-11 09:26:
哦,忘说了,你点build,再点击add atoms,就可以添加原子了。我在版面上发了个关于CASTEP的教程,你可以看看建立晶体模型的过程,非常详细,对你会很有帮助的。
[url]http://emuch.net/bbs/viewthread.php?tid=7 ...
下载的ppt是空的。。。。

又下载了一次,有了。谢谢,哈哈

[ Last edited by sunmuer on 2008-4-11 at 10:57 ]

作者: sunmuer   发布日期: 2008-04-11
QUOTE:
Originally posted by hopingzmn at 2008-4-11 09:27:


出来的是个空盒子才是正常的,然后点击Build 》Add atoms,弹出的对话框中点Atoms标签,修改Element,点击右边的“...”会出来一个元素周期表,选择需要的原子;然后在a:b:c:后面的小框中输入你有的坐标, ...
结构建立了,不过看起来很乱,呵呵

[ Last edited by sunmuer on 2008-4-11 at 10:49 ]

作者: sunmuer   发布日期: 2008-04-11
啊,刚才看了下MS的教程,发现需要在做一次Rebuild,然后图形就清楚多了
后面还会有个symmetry/primitive cell,这样看起来就是一个单胞了?

作者: hopingzmn   发布日期: 2008-04-11
QUOTE:
Originally posted by sunmuer at 2008-4-11 10:44:


结构建立了,不过看起来很乱,呵呵

[ Last edited by sunmuer on 2008-4-11 at 10:49 ]
在建立结构右键选择Display Style,改变显示的形式可能看起来方便些,通常使用Ball and stick(球棍模型)显示。

使用primitive cell可以有效渐少计算费时

[ Last edited by hopingzmn on 2008-4-11 at 11:29 ]

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